I. Gearfetting
Peptiden binne spesjale makromolekulen, sadat har sekwinsjes ûngewoan binne yn har gemyske en fysike eigenskippen.Guon peptiden binne lestich te synthetisearjen, wylst oaren relatyf maklik te synthetisearjen binne, mar lestich te suverjen.It praktyske probleem is dat de measte peptiden in bytsje oplosber binne yn wetterige oplossingen, dus yn ús suvering moat it oerienkommende diel fan it hydrofobe peptide oplost wurde yn net-wetterige solvents, Dêrom binne dizze solvents of buffers wierskynlik sterk ynkonsistint mei it gebrûk fan biologyske eksperimintele prosedueres, sadat technici binne strang ferbean om it peptide foar har eigen doelen te brûken, sadat de folgjende ferskate aspekten binne fan it ûntwerp fan peptiden foar ûndersikers.
Untwerpskema en oplossing fan polypeptidepeptideketen
Twad, de juste kar fan syntetyske lestige peptiden
1. Totale lingte fan down-regulearre sekwinsjes
Peptiden fan minder dan 15 resten binne makliker te krijen, om't de grutte fan it peptide ferheget en de suverens fan it rûge produkt ôfnimt.Om't de totale lingte fan 'e peptideketen grutter wurdt as 20 resten, is de krekte produktkwantiteit in wichtige soarch.Yn in protte eksperiminten is it maklik om ûnferwachte effekten te krijen troch it residunûmer ûnder 20 te ferleegjen.
2. Ferminderje it oantal hydrofobe resten
Peptiden mei in grut oerwicht fan hydrofobe residuen, benammen yn 'e regio 7-12 residuen fan 'e C-terminus, feroarsaakje meastentiids syntetyske swierrichheden.Dit wurdt sjoen as in ûnfoldwaande kombinaasje krekt omdat in B-fold sheet wurdt krigen yn de synteze."Yn sokke gefallen kin it nuttich wêze om mear dan twa positive en negative resten te konvertearjen, of Gly of Pro yn it peptide te setten om de peptide-komposysje te ûntsluten."
3. Downregulation fan "drege" resten
"D'r binne in oantal Cys-, Met-, Arg- en Try-residu's dy't oer it algemien net maklik synthesisearre wurde."Ser sil typysk brûkt wurde as in nonoxidative alternatyf foar Cys.
Untwerpskema en oplossing fan polypeptidepeptideketen
Tredde, ferbetterje de juste kar fan oplosber yn wetter
1. Pas de N of C terminus
Relatyf oan soere peptiden (dat is negatyf opladen by pH 7), wurdt acetylaasje (N-terminus acetylaasje, C-terminus altyd in frije karboksylgroep behâldt) benammen oanrikkemandearre om de negative lading te ferheegjen.Foar basale peptiden (dat is, posityf opladen by pH 7), wurdt aminaasje (frije aminogroep oan 'e N-terminus en aminaasje oan' e C-terminus) benammen oanrikkemandearre om de positive lading te ferheegjen.
2. Ferkoart of ferlingje de folchoarder sterk
Guon fan 'e sekwinsjes befetsje in grut oantal hydrofobe aminosoeren, lykas Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr en Ala, ensfh.It kin nuttich wêze om de folchoarder te ferlingjen om de positive en negative poalen fan it peptide fierder te fergrutsjen.De twadde opsje is om de grutte fan 'e peptideketen te downregulearjen om de positive en negative poalen te fergrutsjen troch de hydrofobe resten te downregulearjen.Hoe sterker de positive en negative kanten fan 'e peptideketen, hoe mear kâns it is om te reagearjen mei wetter.
3. Set yn in wetter-oplosber residu
Foar guon peptideketen kin de kombinaasje fan guon positive en negative aminosoeren de wetteroplosberens ferbetterje.Us bedriuw advisearret de N-terminus as C-terminus fan soere peptiden te kombinearjen mei Glu-Glu.De N- of C-terminus fan it basispeptide waard jûn en dan Lys-Lys.As de opladen groep kin net pleatst wurde, kin Ser-Gly-Ser ek pleatst wurde yn de N of C terminus.Dizze oanpak wurket lykwols net as de kanten fan 'e peptideketen net kinne wurde feroare.
Post tiid: mei-12-2023